David Samzun, président de la CARENE, prépare et met en œuvre les décisions des deux assemblées délibérantes (délibérations). Il agit également par délégation du Conseil communautaire sous forme de « décisions du Président » et « arrêtés du Président ».

Le Bureau communautaire est formé de 15 vice-présidents et du président, désignés par le Conseil communautaire. Le Bureau délibère sur des domaines préalablement fixés par le Conseil.

Le Conseil communautaire, composé de 60 délégués représentant les 10 conseils municipaux des communes de l'agglomération. Il délibère sur les grandes orientations de la CARENE et vote le budget. Le Conseil est l'organe délibérant de base de la CARENE. Pour un fonctionnement plus fluide, il a délégué une partie de ses pouvoirs au Bureau communautaire, ainsi qu'au Président.

Cinq commissions sont chargées d'étudier les questions soumises au Conseil. Chacune est animée par au moins un(e) Vice-président(e) en tant que rapporteur :

• la commission Grands services publics, avec Jean-Jacques Lumeau et François Chéneau
• la commission Développement économique et Attractivité, avec Michèle Lemaitre, Jean-Claude Pelleteur, Franck Hervy et Françoise Lestien
• la commission Urbanisme et aménagement durable, avec Alain Michelot et Eric Provost
• la commission Habitat, avec Jérôme Dholland et Alain Manara
• la commission Transition écologique et énergétique, avec Pascale Hameau

Enfin, l'équipe technique prépare les dossiers et applique les décisions.
La CARENE est une administration composée d'environ 325 agents répartis dans les directions et services placés sous l'autorité de la direction générale des services :

• la direction générale de l'action économique ;
• la direction générale de l'habitat ;
• la direction générale des grands services publics ;
• la direction générale de l'aménagement opérationnel ;
• la direction générale des affaires financières et juridiques ;
• la direction générale de l'organisation des des ressources humaines ;
• La direction générale de l'information et de la communication
• La direction générale cadre de vie